La Faculté de théologie protestante assure la formation d’enseignants chercheurs et de chercheurs en théologie protestante et en sciences religieuses, ainsi que de professionnels spécialisés (pasteurs, enseignants de religion en collège ou en lycée). Elle propose, en outre, des compléments de formation aux acteurs des milieux ecclésiaux et socio-éducatifs et divers cycles de conférences et diplômes destinés à un large public.