Cette UE est composée de travaux pratiques de microbiologie dont le fil conducteur est l’identification bactérienne, le dénombrement de micro-organismes d'un échantillon naturel (terre) et l'observation microscopiques de levures et moisissures. Elle comprend aussi des cours préparatoires aux travaux pratiques permettant d’acquérir les connaissances théoriques requises à la bonne compréhension des expériences:
- milieux de culture (synthétiques, complexes, sélectifs, différentiels)
- caractères culturaux et morphologiques des bactéries, leur mobilité
- des voies métaboliques impliquées dans les milieux d'identification
- sporulation bactérienne
- diversité microbienne d'un écosystème
Les travaux dirigés étudient la croissance exponentielle et les cultures discontinues à base d’exercices qui permettent aussi d’aborder quelques notions de physiologie, d’écologie, de biotechnologie. Ils permettent d'exercer les calculs de dénombrement et abordent la stérilisation.
 

- Connaitre et exercer les bonnes pratiques des techniques fondamentales de la microbiologie (conditions aseptiques).
- Décrire des micro-organismes par observations macroscopiques et microscopiques de cultures bactériennes par examen direct ou après coloration (Gram, spores).
- Différencier les bactéries, des levures et des moisissures.
- Lire et révéler des tests biochimiques et enzymatiques.
- Apprendre les principes et règles de dénombrements par la technique classique des dilutions-étalements sur milieux gélosés.
- Savoir isoler et identifier des bactéries à partir d'un mélange complexe.
 

Tortora, Introduction à la Microbiologie
Prescott, Microbiologie
Le Minor, Bactériologie médicale
Singleton, Abrégé de Bactériologie
Schlegel, Biology of the prokaryotes
Brock, Biology of microorganisms