Cette UE présente d'une part différents environnements et processus dans lesquels les microorganismes jouent un rôle clé et d'autre part les techniques permettant d'étudier ces microorganismes et de caractériser leurs activités. L'UE est composée de cours, de travaux dirigés et de travaux pratiques. Le contenu aborde les différents thèmes suivant :

• dégradation microbienne des hydrocarbures
• phytoremédiation assistée par les microorganismes
• processus microbiens dans les stations d'épuration
• enzymologie microbienne
• écotoxicologie microbienne
• dénombrements bactériens

• Connaître les techniques d'étude des microorganismes dans différents environnements
• Proposer et maîtriser des techniques d'étude des microorganismes dans l'environnement
• Analyser et critiquer des résultats d'expériences
• Restituer des résultats d'expérience sous forme de rapport scientifique

Les étudiant(e)s voulant suivre cette UE devront avoir suivi au préalable des enseignements en microbiologie et notamment en pratique.